Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDM2Q00987 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms