Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP107P57740 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP107P57740 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms