Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPAP53621 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPAP53621 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms