Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RAB5AP20339 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RAB5AP20339 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RAB5AP20339 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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