Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DESP17661 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DESP17661 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms