Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRF1P14222 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms