Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms