Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEPDP12955 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEPDP12955 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PEPDP12955 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PEPDP12955 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PEPDP12955 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PEPDP12955 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEPDP12955 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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