Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3P09919 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3P09919 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3P09919 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3P09919 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF3P09919 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF3P09919 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF3P09919 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms