Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED1O96006 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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