Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX4O95219 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX4O95219 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX4O95219 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX4O95219 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX4O95219 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX4O95219 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX4O95219 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX4O95219 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX4O95219 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX4O95219 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX4O95219 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms