Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms