Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PDE6DO43924 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PDE6DO43924 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PDE6DO43924 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PDE6DO43924 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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