Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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