Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms