Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DXG7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms