Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FRMD3A2A2Y4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FRMD3A2A2Y4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms