Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms