Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM2AQ9Y2K7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms