Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms