Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms