Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms