Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms