Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms