Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms