Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms