Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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