Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116348.1-201ENST00000562525 528 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL9-201ENST00000360096 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL122008.3-201ENST00000412483 1723 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513475.2-201ENST00000402316 392 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHFPL3-AS1-202ENST00000416376 866 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162253.1-201ENST00000443792 758 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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