Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms