Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBPQ99417 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MYCBPQ99417 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms