Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
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