Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms