Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms