Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms