Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN19Q8N6F1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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CLDN19Q8N6F1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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CLDN19Q8N6F1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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CLDN19Q8N6F1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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CLDN19Q8N6F1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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CLDN19Q8N6F1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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CLDN19Q8N6F1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CLDN19Q8N6F1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CLDN19Q8N6F1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN19Q8N6F1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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