Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEM1Q6ZVN7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms