Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VSTM1Q6UX27 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms