Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms