Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms