Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms