Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PUM3Q15397 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PUM3Q15397 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
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PUM3Q15397 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PUM3Q15397 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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