Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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