Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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