Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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