Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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