Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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