Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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