Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms