Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms