Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms